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发布日期:2024-09-29 11:16    点击次数:195

近日下载AG百家乐,华中农业大学园艺坛学学院、果蔬园艺作物种质革新与左右世界重心本质室匡汉晖讲授团队,计议武汉华大人命科学筹商院魏桐筹商员团队和华中农业大学作物遗传矫正世界重心本质室杨全能讲授团队在《Genome Biology》杂志在线发表了题为“Dissecting the genetic architecture of key agronomic traits in lettuce using a MAGIC population”的筹商论文。该筹商通过构建寰球首个生菜多亲本高世代互交群体(MAGIC),蛊惑高通量表型组本事表征分析和GWAS系统领路了生菜叶色、着花时刻和叶形等过错农艺性状的遗传调控荟萃,揭示了生菜独有农艺性状酿成的分子机制,为生菜的野心育种奠定了遗传基础。

生菜是寰球迫切的叶用蔬菜,叶片脸色、样式和着花时刻是决定其商品价值的过错农艺性状。但其丰富的园艺类型和显赫的群体结构异质性为遗传领路带来挑战,传统双亲群体因遗传各样性有限,难以全面领路复杂性状。为此,筹商团队历时多年,左右16个遗传配景丰富的生菜种质(包含结球、散叶、罗马等培植材料14个和野莴苣材料2个),初度得胜构建包含381个重组自交系的莴苣多亲本高世代互交(MAGIC)群体。全基因组测序分析标明,该群体遗传结构均匀、重组事件丰富,率性了传统群体结构的截止,为高效全基因组相关分析(GWAS)奠定了基础(图1)。

图1 生菜MAGIC种群的构建及种群结构

为了科学量化领路生菜叶色和叶形的复杂多态表型性状,本筹商接纳了高光谱成像(HSI)、RGB成像和3D激光扫描成像三种高通量表型组学才调进行表型分析,同期蛊惑在东谈主工表型统计,基于该MAGIC群体的GWAS浮滑了多个与迫切农艺性状相关的位点,包括51个与着花时刻相关的位点、11个与叶色相关的位点,以及5个与叶形相关的位点。

本筹商基于HSI和RGB成像对叶色的GWAS浮滑了9个显赫相关位点(qLC1-9),AG真人百家乐线路其中4个(qLC6-9)与生菜叶片脸色相关的已知基因共定位,qLC6、qLC7和qLC8分辩编码bHLH、MYB和ANS卵白,这些卵白之前已被证明注解不错适度生菜的红叶和绿叶。qLC9 基因座与LsGLK基因重迭,后者是适度生菜叶片叶绿素浓度的主要QTL。其余5个位点(qLC1-5)是本筹商中初度发现。同期,筹商发现生菜红茎和红叶性状调控信号存在重迭,但不悉数交流,标明生菜叶色彩控的复杂性(图2)。

图2 生菜叶色/茎色的调控遗传领路

本筹商通过GWAS浮滑到51个与着花时刻显赫相关的位点,证实序列变异、估计卵白质功能以及候选区域中的eQTL,筛选浮滑并考证了部分候选基因。其中光敏色素基因LsphyB和LsphyC的功能缺失突变会显赫蔓延生菜着花时刻,这与拟南芥等物种中光敏色素促进着花的经典模式迥然相异。这一发现揭示了生菜在进化经过中酿成的独有光周期反应机制,为培育耐抽薹品种提供了迫切的基因资源(图3)。

图3 MAGIC群体着花时刻的GWAS分析及相关基因的考证

此外,本筹商基于高通量表型组学才调量化表征了叶片步地和大小对应的表型。通过GWAS浮滑到5个与叶卷曲、叶裂、叶片长度、叶片宽度、叶单方面积和叶尖步地显赫相关的位点。进一步综合定位并考证了LsTCP4基因调控生菜叶卷曲的功能(图4),同期,筛选浮滑了LsZFP基因是生菜通盘类型裂叶发育所必需的(图5)。

图4 LsTCP4基因调控生菜叶卷曲的功能考证

图5 LsZFP基因调控生菜叶裂/不裂

本筹商构建的生菜MAGIC群体因无显赫群体结构,以及高分辨率定位才调,可高效领路生菜复杂农艺性状的遗传调控基础。已浮滑的位点和候选基因为莴苣农艺性能与叶片品性矫正提供了迫切遗传资源,为生菜的野心育种奠定基础。将来可用于领路其他迫切性状的遗传基础,举例生菜的养分品性和抗逆性筹商。

华中农业大学匡汉晖讲授、武汉华大人命科学筹商院魏桐筹商员、华中农业大学杨全能讲授为该筹商共同通信作家,武汉华大人命科学筹商院副筹商员陈宏运、华中农业大学陈炯炯副讲授、翟瑞芳副讲授为该筹商共同第一作家,华中农业大学莴苣团队多位中枢成员参与。本筹商得回国度当然科学基金 (31830079, 32372719) 的资助。

论文相连:

https://doi.org/10.1186/s13059-025-03541-6

起头:华中农业大学园艺坛学学院





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